Package org.biojava.nbio.ws.hmmer

Class HmmerDomain

  • All Implemented Interfaces:
    java.io.Serializable, java.lang.Comparable<HmmerDomain>
    public class HmmerDomain
extends java.lang.Object
implements java.lang.Comparable<HmmerDomain>, java.io.Serializable
    Provides the details of a domain hit
    Since:
    3.0.3
    Author:
    Andreas Prlic
    See Also:
    Serialized Form

    • Constructor Detail

      • HmmerDomain

        public HmmerDomain()

    • Method Detail

      • getEvalue

        public java.lang.Float getEvalue()

      • setEvalue

        public void setEvalue​(java.lang.Float evalue)

      • getSqFrom

        public java.lang.Integer getSqFrom()

      • setSqFrom

        public void setSqFrom​(java.lang.Integer sqFrom)

      • getSqTo

        public java.lang.Integer getSqTo()

      • setSqTo

        public void setSqTo​(java.lang.Integer sqTo)

      • getAliLenth

        public java.lang.Integer getAliLenth()

      • setAliLenth

        public void setAliLenth​(java.lang.Integer aliLenth)

      • getSimCount

        public java.lang.Integer getSimCount()

      • setSimCount

        public void setSimCount​(java.lang.Integer simCount)

      • getHmmFrom

        public java.lang.Integer getHmmFrom()

      • setHmmFrom

        public void setHmmFrom​(java.lang.Integer hmmFrom)

      • getHmmTo

        public java.lang.Integer getHmmTo()

      • setHmmTo

        public void setHmmTo​(java.lang.Integer hmmTo)

      • getHmmName

        public java.lang.String getHmmName()

      • setHmmName

        public void setHmmName​(java.lang.String hmmName)

      • getHmmDesc

        public java.lang.String getHmmDesc()

      • setHmmDesc

        public void setHmmDesc​(java.lang.String hmmDesc)

      • getHmmAcc

        public java.lang.String getHmmAcc()

      • setHmmAcc

        public void setHmmAcc​(java.lang.String hmmAcc)

      • toString

        public java.lang.String toString()
        Overrides:
        toString in class java.lang.Object

      • compareTo

        public int compareTo​(HmmerDomain o)
        Specified by:
        compareTo in interface java.lang.Comparable<HmmerDomain>