Constructor Detail

• BlastXMLQuery

  public BlastXMLQuery(java.lang.String blastFile)
                throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

Method Detail

• getHitsQueryDef

  public java.util.LinkedHashMap<java.lang.String,java.util.ArrayList<java.lang.String>> getHitsQueryDef(double maxEScore)
                                                                                                  throws java.lang.Exception

  Throws:

  java.lang.Exception

• main

  public static void main(java.lang.String[] args)